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cladistica [2023/01/26 17:16] fplmarques [RECURSOS COMPUTACIONAIS] |
cladistica [2023/01/26 20:36] fplmarques [Aulas & Tutoriais] |
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===== Locais e Horários ===== | ===== Locais e Horários ===== | ||
- | **//Aulas presenciais às quintas-feiras na Sala de Anatomia do Bloco Didático do IB, das 14:00 as 16:00 //** | + | **//Aulas presenciais às quintas-feiras na Sala 5 do Bloco Didático do IB, das 14:00 as 16:00 //** |
- | ou | + | ===== Equipe 2023 ===== |
- | + | ||
- | **//Aulas remotas via ZOOM às quintas-feiras, das 14:00 as 16:00 //** | + | |
- | + | ||
- | ===== Equipe 2022 ===== | + | |
==== Professor responsável ==== | ==== Professor responsável ==== | ||
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==== RECURSOS COMPUTACIONAIS ==== | ==== RECURSOS COMPUTACIONAIS ==== | ||
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- | Devido às restrições da pandemia de COVID-19 que impedem a realização de aulas presenciais e o uso dos compuatdores institucionais para a execução desta disciplina, abaixo há algumas opções para que o aluno possa instalar os programas necessários para efetuar os tutoriais desta disciplina. | ||
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== Uso de máquina Virtual == | == Uso de máquina Virtual == | ||
- | A opção mais fácil para usuários de WINDOWS a IOSX (MAC) é a instalação da máquina virtual do VMWARE. Esta máquina virtual ocupará 6 Gb de espaço de disco e requer pelo menos 4 Gb de RAM disponível em seu computador. Vaso esse seja o máximo disponível de RAM em seu computador, antes de iniciar a máquina virtual reduza a demanada de RAM nas opçÕes de configuração do VMWARE. Aque está os passos para a instalação da imagem:\\ | + | A opção mais fácil para usuários de WINDOWS a IOSX (MAC) é a instalação da máquina virtual do VMWARE. Esta máquina virtual ocupará 20 Gb de espaço de disco e requer pelo menos 4 Gb de RAM disponível em seu computador. Vaso esse seja o máximo disponível de RAM em seu computador, antes de iniciar a máquina virtual reduza a demanada de RAM nas opçÕes de configuração do VMWARE. Aque está os passos para a instalação da imagem:\\ |
- Faça o download e instale o [[https://www.vmware.com/products/workstation-player/workstation-player-evaluation.html|VMWare Player]]. | - Faça o download e instale o [[https://www.vmware.com/products/workstation-player/workstation-player-evaluation.html|VMWare Player]]. | ||
- | - Faça o download a [[http://lhe.ib.usp.br/downloads/inferencia_filogenetica.zip| máquina virtual]]. | + | - Faça o download da {{ :wiki:clad:app:inferencia_filogenetia_xubuntu_2023.zip|maquina virtual}} ou se preferir execute o comando: |
+ | <code> | ||
+ | wget http://lhe.ib.usp.br/downloads/inferencia_filogenetia_xubuntu_2023.zip | ||
+ | </code> | ||
- Descompacte a maquina virtual (unzip) | - Descompacte a maquina virtual (unzip) | ||
- Inicie o VMWare Player e siga as instruções gerais [[https://geek-university.com/vmware-player/move-a-virtual-machine/|deste tutorial]]. | - Inicie o VMWare Player e siga as instruções gerais [[https://geek-university.com/vmware-player/move-a-virtual-machine/|deste tutorial]]. | ||
- Ao abrir a máquina virtual você deverá obter a tela de inicio do Ubuntu com o usuário Alan Turing. Clique no usuário e digite a senha: turing. | - Ao abrir a máquina virtual você deverá obter a tela de inicio do Ubuntu com o usuário Alan Turing. Clique no usuário e digite a senha: turing. | ||
- | == Instalação do Ubuntu 18.04 == | + | == Instalação do Ubuntu 22.04 == |
Caso o aluno opte por instalar o Ubuntu em sua máquina, recomendo a instalação da versão 18.04 LTS para a qual os tutoriais estão otimizados nesta disciplina.Esses são os passos a serem seguidos: | Caso o aluno opte por instalar o Ubuntu em sua máquina, recomendo a instalação da versão 18.04 LTS para a qual os tutoriais estão otimizados nesta disciplina.Esses são os passos a serem seguidos: | ||
- | - Baixe a imagem do [[https://releases.ubuntu.com/18.04/|Ubuntu 18.04 LTS]]. | + | - Baixe a imagem do [[https://releases.ubuntu.com/22.04/|Ubuntu 22.04 LTS]]. |
- Instalale Ubuntu em seu computador. Lembro que o Ubuntu pode ser instalado com a opção de dual boot, preservando o sistema operacional existente em sua máquina ([[https://opensource.com/article/18/5/dual-boot-linux|mais informações aqui]]). | - Instalale Ubuntu em seu computador. Lembro que o Ubuntu pode ser instalado com a opção de dual boot, preservando o sistema operacional existente em sua máquina ([[https://opensource.com/article/18/5/dual-boot-linux|mais informações aqui]]). | ||
- Após a instalação, entre no Ubuntu e baixe o {{ :wiki:clad:app:install_packages_ubuntu_22.04.zip |script de instalação}}. | - Após a instalação, entre no Ubuntu e baixe o {{ :wiki:clad:app:install_packages_ubuntu_22.04.zip |script de instalação}}. | ||
- | - Unzip (descompacte) o arquivo applications4ubuntu_18.04LTS.zip. | + | - Unzip (descompacte) o arquivo install_packages_ubuntu_22.04.zip. |
- Execute o script **00_install_all.sh** seguindo as últimas duas últimas linhas de comando do protocolo alternativo abaixo. | - Execute o script **00_install_all.sh** seguindo as últimas duas últimas linhas de comando do protocolo alternativo abaixo. | ||
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</code> | </code> | ||
- | **ATENÇÃO:** Durnante a execução desse script será necessário inserir a senha de administração do sistema "turing". Desta forma acompanhe. Caso haja algum erro, tofografe a tela e remeta um email para a disciplina para que eu possa corrigir eventuais erros. | + | **ATENÇÃO:** Durante a execução desse script será necessário inserir a senha de administração do sistema "turing" e responder alguns chamados de instalação. Desta forma acompanhe. Caso haja algum erro, fofografe a tela e remeta um email para a disciplina para que eu possa corrigir eventuais erros. |
== Outras versões de Linux == | == Outras versões de Linux == | ||
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===== Aulas & Tutoriais ===== | ===== Aulas & Tutoriais ===== | ||
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+ | Todos os tutorias podem ser baixados do GitHub com o seguinte comando de linha: | ||
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+ | <code> | ||
+ | svn checkout https://github.com/fplmarques/cladistica/trunk/tutorials/ | ||
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==== Aula 1 ==== | ==== Aula 1 ==== | ||