0410107 - Princípios de Sistemática e Biogeografia

Sobre a disciplina


Objetivos

O objetivo da disciplina é proporcionar aos alunos os fundamentos de sistemática e biogeografia, além de noções básicas de taxonomia, classificação e nomenclatura biológica. O curso é orientado através dos conceitos teóricos e práticos do método filogenético, com ênfase nas suas interações com o estudo da biodiversidade e evolução biológica. Métodos alternativos são também discutidos. O conteúdo é apresentado na forma de aulas expositivas e estudos práticos dirigidos. O objetivo é capacitar o aluno a entender e organizar informação biológica de uma forma comparativa e filogeneticamente coerente.

Equipe 2020

Docentes

Dra. Elen Arroyo Peres [Depto. de Zoologia]
Dr. Fernando Portella de Luna Marques [Depto. de Zoologia]
Dr. Renato Mello Silva [Depto. de Botânica] CONTATO

Estagiários & Monitores

P.A.E.

Alfredo Leonardo Porfirio de Sousa [DO-Zoologia]
Bruna Trevisan Souza Szucko [DO-Zoologia]
Kleber Mathubara Leite [DO-Zoologia]
Robberson Bernal Setubal [ME-Botânica]

Graduação

Giovanni Cardoso dos Santos Correia [GRAD - 016]
Pedro Goulart Suzuki [GRAD - 019]
Sofia Celedon Andre [GRAD - 018]

Cronograma

Locais e Horários

Aulas Teóricas: Auditório Geral da Zoologia (IB/USP)
Aulas Práticas: Sala de Anatomia do Bloco Didático (IB/USP)
Aulas às sextas-feiras, das 14:00 as 18:00 (Diurno) e das 19:00 as 23:00 (Noturno)
Atendimento ao aluno: Todas as quartas-feiras (exceto semanas de provas), sala 143, Zoologia das 17:00 as 19:00 hrs.

Materiais Didáticos


Exercícios práticos


Exercício 1 - 2a. Semana: 06 de março de 2020. PDF

Figura suplementar (será fornecida em sala de aula):PDF

Exercício 2 - 3a. Semana: 13 de março de 2020. PDF

Exercício 3 - 4a. Semana: 20 de março de 2020. PDF

Exercício 4 - 5a. Semana: 27 de março de 2020. PDF

Exercício 5 - 6a. Semana: 03 de abril de 2020. PDF

Exercício 6 - 7a. Semana: 17 de abril de 2020 (em aula) PDF

Exercício 7 - 8a. Semana: 04 de maio de 2020. PDF

Exercício 8 - 9a. Semana: 08 de maio de 2020. PDF

Exercício 9 - 10. Semana: 15 de maio de 2020. ZIP

Exercício 10 - 12. Semana: 22 de maio de 2020. PDF

Aulas teóricas


Aula 1: 28 de fevereiro de 2020 - Apresentação do curso e conceitos iniciais. PDF

Aula 2: 08 de março de 2020 - Essescialismo, origem das semelhanças, Nova Síntese e Sistemática Evolutiva.PDF

Aula 3: 13 de março de 2020 - Inferência filogenética, fenética e diagramas dicotômicos. PDF

Aula 4: 20 de março de 2020 - Introdução à cladística, topologia e otimização. PDF

Aula 5: 27 de março de 2020 - Enraizamento, terminologia cladística e otimização. PDF

Leitura recomendada nos guias de aula prática


Aula Prática 1

Artigos de interesse

Textos suplementares de aulas

Tópicos gerais

Conceito de espécies

Livros & Apostilas

Vídeos: Conceitos fundamentais


Introdução à Sistemática: Aristóteles a Sistemática Evolutiva



Linhagens e descendência com modificação



Anagênese, Cladogênese e Diversidade Biológica



Compartilhamento de similaridades, nível de generalidade, homologia e homoplasia



Lógica da inferência filogenética e a pertinência de diagramas dicotômicos



Fenética ou Taxonomia Numérica



Princípios da Cladística



Otimização



Enraizamento de diagramas dicotômicos



Enraizamento e definições de grupos



Enraizamento e termos associados à caracteres e estados de caráter



Suporte cladístico e árvores de consenso



Verossimilhanca (Likelihood) e estimativa de máxima verossimilhança



Verossimilhanca como critério de otimização em inferência filogenética




Notas e Frequência


Integral

Código Quiz 01 Quiz 02 Quiz 03 Quiz 04 Quiz 05 Quiz 06 Quiz 07 Quiz 08 Quiz 09 Quizz 10 Quizz 11 Média Média Final
LV-ouvinte 4.0 7.0 - - - - - - - - -
230588 4.0 5.0 - - - - - - - - -
1500326 9.0 5.0 - - - - - - - - -
3465126 NC NC - - - - - - - - -
4482170 6.0 7.0 - - - - - - - - -
4654525 5.0 7.0 - - - - - - - - -
4997726 8.0 NC - - - - - - - - -
5509872 7.0 4.0 - - - - - - - - -
8591015 NC NC - - - - - - - - -
9276213 NC NC - - - - - - - - -
9303290 NC NC - - - - - - - - -
10408726 NC 7.0 - - - - - - - - -
10424822 NC NC - - - - - - - - -
10694463 5.0 3.0 - - - - - - - - -
10694608 NC 7.0 - - - - - - - - -
10737053 7.0 7.0 - - - - - - - - -
10740377 8.0 9.0 - - - - - - - - -
10764151 8.0 7.0 - - - - - - - - -
10830530 3.0 NC - - - - - - - - -
11045536 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11217534 5.0 9.0 - - - - - - - - -
11225231 6.0 9.0 - - - - - - - - -
11266814 4.0 7.0 - - - - - - - - -
11372010 5.0 7.0 - - - - - - - - -
11780012 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11780040 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11780054 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11780061 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11780075 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11780116 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11780137 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11780141 6.0 8.0 - - - - - - - - -
11780158 9.0 10.0 - - - - - - - - -
11780179 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11780183 8.0 6.0 - - - - - - - - -
11780190 7.0 10.0 - - - - - - - - -
11780210 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11780224 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11780245 9.0 10.0 - - - - - - - - -
11780252 NC NC - - - - - - - - -
11780482 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11780499 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11780502 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11780519 7.0 9.0 - - - - - - - - -
11780530 6.0 6.0 - - - - - - - - -
11780544 8.0 4.0 - - - - - - - - -
11780590 NC NC - - - - - - - - -
11780610 6.0 6.0 - - - - - - - - -
11780627 4.0 8.0 - - - - - - - - -
11780631 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11818002 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11818016 9.0 10.0 - - - - - - - - -
11818037 5.0 7.0 - - - - - - - - -
11831982 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11836924 7.0 5.0 - - - - - - - - -
11837219 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11838082 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11838332 9.0 9.0 - - - - - - - - -
11839117 5.0 8.0 - - - - - - - - -
11839396 4.0 NC - - - - - - - - -
11839681 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11847583 7.0 9.0 - - - - - - - - -
11847753 6.0 5.0 - - - - - - - - -
11848970 9.0 6.0 - - - - - - - - -
11849564 8.0 10.0 - - - - - - - - -
11877020 6.0 6.0 - - - - - - - - -
11882461 4.0 5.0 - - - - - - - - -
11883455 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11892070 7.0 9.0 - - - - - - - - -
11912881 8.0 6.0 - - - - - - - - -
11913493 6.0 5.0 - - - - - - - - -
11914066 9.0 9.0 - - - - - - - - -
11914639 NC NC - - - - - - - - -
11915686 5.0 6.0 - - - - - - - - -
11916454 8.0 8.0 - - - - - - - - -
80758236 4.0 4.0 - - - - - - - - -

Notuno

Código Quiz 01 Quiz 02 Quiz 03 Quiz 04 Quiz 05 Quiz 06 Quiz 07 Quiz 08 Quiz 09 Quizz 10 Quizz 11 Média Média Final
DMB-ouvinte 7.0 3.0 - - - - - - - - -
2254762 10.0 7.0 - - - - - - - - -
4753602 10.0 6.0 - - - - - - - - -
4862329 9.0 9.0 - - - - - - - - -
5926183 NC NC - - - - - - - - -
7010863 6.0 NC - - - - - - - - -
8940208 6.0 6.0 - - - - - - - - -
9819124 5.0 4.0 - - - - - - - - -
10282216 8.0 7.0 - - - - - - - - -
10289568 6.0 8.0 - - - - - - - - -
10296160 8.0 7.0 - - - - - - - - -
10330115 8.0 10.0 - - - - - - - - -
10379008 NC NC - - - - - - - - -
10686770 6.0 8.0 - - - - - - - - -
10686811 9.0 NC - - - - - - - - -
10704716 8.0 6.0 - - - - - - - - -
10755404 7.0 NC - - - - - - - - -
10757880 5.0 3.0 - - - - - - - - -
10765698 NC NC - - - - - - - - -
10880697 5.0 3.0 - - - - - - - - -
11191206 7.0 7.0 - - - - - - - - -
11231781 7.0 6.0 - - - - - - - - -
11269925 7.0 7.0 - - - - - - - - -
11270382 8.0 6.0 - - - - - - - - -
11277365 5.0 6.0 - - - - - - - - -
11277650 7.0 9.0 - - - - - - - - -
11318804 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11318892 NC NC - - - - - - - - -
11421293 4.0 4.0 - - - - - - - - -
11734994 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11737642 6.0 NC - - - - - - - - -
11737739 4.0 8.0 - - - - - - - - -
11737750 8.0 6.0 - - - - - - - - -
11780102 5.0 6.0 - - - - - - - - -
11780231 9.0 10.0 - - - - - - - - -
11780266 6.0 9.0 - - - - - - - - -
11780270 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11780311 5.0 NC - - - - - - - - -
11780328 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11780332 9.0 NC - - - - - - - - -
11780349 7.0 7.0 - - - - - - - - -
11780353 4.0 5.0 - - - - - - - - -
11780360 9.0 9.0 - - - - - - - - -
11780374 7.0 6.0 - - - - - - - - -
11780381 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11780401 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11780415 7.0 4.0 - - - - - - - - -
11780422 7.0 NC - - - - - - - - -
11780436 10.0 10.0 - - - - - - - - -
11780440 10.0 NC - - - - - - - - -
11780457 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11780461 10.0 5.0 - - - - - - - - -
11780478 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11780551 7.0 6.0 - - - - - - - - -
11780565 9.0 NC - - - - - - - - -
11780572 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11780586 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11780606 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11780648 8.0 3.0 - - - - - - - - -
11780652 7.0 NC - - - - - - - - -
11780669 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11818020 8.0 6.0 - - - - - - - - -
11818041 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11818058 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11818062 9.0 7.0 - - - - - - - - -
11818079 10.0 8.0 - - - - - - - - -
11836389 7.0 7.0 - - - - - - - - -
11838742 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11846067 8.0 9.0 - - - - - - - - -
11846557 4.0 5.0 - - - - - - - - -
11847113 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11847728 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11850740 8.0 7.0 - - - - - - - - -
11855467 6.0 8.0 - - - - - - - - -
11880181 NC NC - - - - - - - - -
11880480 7.0 8.0 - - - - - - - - -
11885120 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11885519 NC 5.0 - - - - - - - - -
11892132 7.0 5.0 - - - - - - - - -
11908757 9.0 8.0 - - - - - - - - -
11908830 NC NC - - - - - - - - -
11910506 10.0 NC - - - - - - - - -
11911852 8.0 8.0 - - - - - - - - -
11918838 6.0 9.0 - - - - - - - - -
11925513 NC 2.0 - - - - - - - - -