Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- cladistica [2023/01/25 12:38]
fplmarques [Aula 11]
+++ cladistica [2023/01/26 20:37] (current)
fplmarques [Aula 1]
@@ Line 12: / Line 12: @@
 ===== Locais e Horários =====
-**//Aulas presenciais às quintas-feiras na Sala de Anatomia do Bloco Didático do IB, das 14:00 as 16:00 //**
+**//Aulas presenciais às quintas-feiras na Sala 5 do Bloco Didático do IB, das 14:00 as 16:00 //**
-ou
+===== Equipe 2023 =====
-**//Aulas remotas via ZOOM às quintas-feiras, das 14:00 as 16:00 //**
-===== Equipe 2022 =====
 ==== Professor responsável ====
@@ Line 54: / Line 50: @@
 ==== RECURSOS COMPUTACIONAIS ====
-Devido às restrições da pandemia de COVID-19 que impedem a realização de aulas presenciais e o uso dos compuatdores institucionais para a execução desta disciplina, abaixo há algumas opções para que o aluno possa instalar os programas necessários para efetuar os tutoriais desta disciplina.
 == Uso de máquina Virtual ==
-A opção mais fácil para usuários de WINDOWS a IOSX (MAC) é a instalação da máquina virtual do VMWARE. Esta máquina virtual ocupará 6 Gb de espaço de disco e requer pelo menos 4 Gb de RAM disponível em seu computador. Vaso esse seja o máximo disponível de RAM em seu computador, antes de iniciar a máquina virtual reduza a demanada de RAM nas opçÕes de configuração do VMWARE. Aque está os passos para a instalação da imagem:\\
+A opção mais fácil para usuários de WINDOWS a IOSX (MAC) é a instalação da máquina virtual do VMWARE. Esta máquina virtual ocupará 20 Gb de espaço de disco e requer pelo menos 4 Gb de RAM disponível em seu computador. Vaso esse seja o máximo disponível de RAM em seu computador, antes de iniciar a máquina virtual reduza a demanada de RAM nas opçÕes de configuração do VMWARE. Aque está os passos para a instalação da imagem:\\
 	- Faça o download e instale o [[https://www.vmware.com/products/workstation-player/workstation-player-evaluation.html|VMWare Player]].
-	- Faça o download a [[http://lhe.ib.usp.br/downloads/inferencia_filogenetica.zip| máquina virtual]].
+	- Faça o download da {{ :wiki:clad:app:inferencia_filogenetia_xubuntu_2023.zip|maquina virtual}} ou se preferir execute o comando:
+<code>
+   wget http://lhe.ib.usp.br/downloads/inferencia_filogenetia_xubuntu_2023.zip
+</code>
 	- Descompacte a maquina virtual (unzip)
 	- Inicie o VMWare Player e siga as instruções gerais [[https://geek-university.com/vmware-player/move-a-virtual-machine/|deste tutorial]].
 	- Ao abrir a máquina virtual você deverá obter a tela de inicio do Ubuntu com o usuário Alan Turing. Clique no usuário e digite a senha: turing.
-== Instalação do Ubuntu 18.04 ==
+== Instalação do Ubuntu 22.04 ==
 Caso o aluno opte por instalar o Ubuntu em sua máquina, recomendo a instalação da versão 18.04 LTS para a qual os tutoriais estão otimizados nesta disciplina.Esses são os passos a serem seguidos:
-	- Baixe a imagem do [[https://releases.ubuntu.com/18.04/|Ubuntu 18.04 LTS]].
+	- Baixe a imagem do [[https://releases.ubuntu.com/22.04/|Ubuntu 22.04 LTS]].
 	- Instalale Ubuntu em seu computador. Lembro que o Ubuntu pode ser instalado com a opção de dual boot, preservando o sistema operacional existente em sua máquina ([[https://opensource.com/article/18/5/dual-boot-linux|mais informações aqui]]).
-	- Após a instalação, entre no Ubuntu e baixe o [[http://lhe.ib.usp.br/downloads/applications4ubuntu_18.04LTS.zip|script de instalação]].
+	- Após a instalação, entre no Ubuntu e baixe o {{ :wiki:clad:app:install_packages_ubuntu_22.04.zip |script de instalação}}.
-	- Unzip (decompacte) o arquivo applications4ubuntu_18.04LTS.zip.
+	- Unzip (descompacte) o arquivo install_packages_ubuntu_22.04.zip.
-	- Execute o script **install_packages.sh** seguindo as últimas duas últimas linhas de comando do protocolo alternativo abaixo.
+	- Execute o script **00_install_all.sh** seguindo as últimas duas últimas linhas de comando do protocolo alternativo abaixo.
 Os passos 3 a 5 podem ser executados em um terminal da seguinte forma:
-<code> wget http://lhe.ib.usp.br/downloads/applications4ubuntu_18.04LTS.zip
+<code> wget http://lhe.ib.usp.br/downloads/install_packages_ubuntu_22.04.zip
- unzip applications4ubuntu_18.04LTS.zip
+ unzip install_packages_ubuntu_22.04.zip
- cd aplications4ubuntu_18.04LTS
+ cd install_packages_ubuntu_22.04
- chmod 765 install_packages.sh
+ chmod 765 00_install_all.sh
- ./install_packages.sh
+ ./00_install_all.sh
 </code>
-**ATENÇÃO:** Durnante a execução desse script será necessário inserir a senha de administração do sistema "turing". Desta forma acompanhe. Caso haja algum erro, tofografe a tela e remeta um email para a disciplina para que eu possa corrigir eventuais erros.
+**ATENÇÃO:** Durante a execução desse script será necessário inserir a senha de administração do sistema "turing" e responder alguns chamados de instalação. Desta forma acompanhe. Caso haja algum erro, fofografe a tela e remeta um email para a disciplina para que eu possa corrigir eventuais erros.
 == Outras versões de Linux ==
@@ Line 98: / Line 94: @@
 ===== Aulas & Tutoriais =====
+Todos os tutorias podem ser baixados do GitHub com o seguinte comando de linha:
+<code>
+   svn checkout https://github.com/fplmarques/cladistica/trunk/tutorials/
+</code>
 ==== Aula 1 ====
-**Tutorial 1**: Introdução ao Linux. {{:wiki:clad:tutorials:01_tutorial_2019.pdf|PDF}}\\
+**Tutorial 1**: Introdução ao Linux. {{:wiki:clad:tutorials:01_tutorial_2023.pdf|PDF}}\\
  * **//Assignment 1://** Árvores filogenéticas e networks (resenha sobre os artigos de Mindell, 2013 e Morrison, 2014){{:wiki:clad:aulas:01_assignment_trees.pdf|PDF}}

Site Tools

Differences

User Tools

Page Tools

Site Tools